Confirmación de la ausencia del alga marina asiática Codium fragile subsp. fragile (Codiaceae, Chlorophyta) en el Pacífico de México, mediante datos moleculares

Palabras clave: Algas marinas, Baja California, especie nativa, invasores, DNA cloroplasto

Resumen

Antecedentes. Codium fragile es un alga verde que habita en las costas del Pacífico de Baja California, México, cuyos primeros registros datan de 1909. Esta especie que posee varias subespecies, una de ellas Codium fragile subsp. fragile, oriunda de Japón, ha demostrado ser un organismo invasor en diferentes partes del mundo. Objetivos. Confirmar la presencia o ausencia de esta cepa invasora en las costas del Pacífico mexicano, comparando individuos de Japón, Estados Unidos y México mediante el uso de herramientas moleculares. Métodos. Se analizaron 20 individuos de las especies registradas para el Pacífico mexicano y diez fuera de la región, incluyendo además dos como grupo externo. El DNA genómico se extrajo mediante el método Sanger, se amplificaron regiones de los marcadores psb y 23S, las secuencias obtenidas se editaron y alinearon en MEGA y MESQUITE, posteriormente se realizaron análisis filogenéticos de máxima verosimilitud en PAUP y MEGA y de inferencia bayesiana en MrBayes. Las distancias genéticas se obtuvieron en MEGA y PAUP. Resultados. Se demuestra que, genéticamente, los individuos de México integran un clado diferente a la entidad asiática, con distancias genéticas inter-especie que se ubicaron en 6% para el marcador 23S, mientras que para los subclados de C. fragile la distancia entre ellos fue de 0.4%. Para psb, la distancia fue del 25% entre especies y de 2.2% entre estas dos subespecies. Conclusiones. Individuos de California y México se anidaron en el clado nativo C. fragile, mientras que otros procedentes también de California se reconocen con el de Japón como pertenecientes al clado invasor (C. fragile subsp. fragile); así por el momento, se confirma la ausencia de esta cepa invasora en el Pacífico de México.

Descargas

La descarga de datos todavía no está disponible.

Biografía del autor/a

Francisco F. Pedroche, Departamento Ciencias Ambientales, División CBS, UAM-Lerma

Profesor Titular T.C.

Citas

Aguilar-Rosas, L., F.F. Pedroche & J. Zertuche. 2014. Macroalgas marinas introducidas en la costa del Pacífico de México. Estado actual. In: Low-Pfeng, A.M., P.A. Quijón & E.M. Peters-Recagno (eds.). Especies invasoras acuáticas: casos de estudio en ecosistemas de México. Secretaría de Medio Ambiente y Recursos Naturales, Instituto Nacional de Ecología y Cambio Climático y University Prince Edward Island, pp. 81-117.

Blackburn, T.M., F. Essl, T. Evans, P.E. Hulme, J.M. Jeschke, I. Kühn, S. Kumschick, Z. Marková, A. Mrugała, W. Nentwig, J. Pergl, P. Pyšek, W. Rabitsch, A. Ricciardi, D.M. Richardson, A. Sendek, M. Vilà, J.R.U. Wilson, M. Winter, P. Genovesi & S. Bacher. 2014. A unified classification of alien species based on the magnitude of their environmental impacts. PLoS Biology 12(5):e1001850-1001811. DOI:10.1371/journal.pbio.1001850

Bowen, B.W., L.A. Rocha, R.J. Toonen & S.A. Karl. 2013. The origins of tropical marine biodiversity. Trends in Ecology & Evolution 28:359-366.

Briggs, J.C. 1974. Marine zoogeography. McGraw-Hill, New York. 475 p.

Brodie, J., C.A. Maggs & D.M. John. 2007. Green seaweeds of Britain and Ireland. British Phycological Society, London. 250 p.

CABI (Centre for Agricultural Bioscience International). 2021. Invasive Species Compendium. Wallingford, UK: CAB International. Available online at: www.cabi.org/isc. (downloaded September 3, 2021).

Collins, F.S. 1909. The green algae of North America. Tufts College Studies (Science) 2:79-480. CONABIO (Comisión Nacional para Conocimiento y Uso de la Biodiversidad). 2021. Especies exóticas invasoras. Ciudad de México. Diusponible en línea en: https://enciclovida.mx/exoticas-invasoras (consultado el 3 septiembre 2021).

Cox, G.W. 2004. Alien species and evolution: the evolutionary ecology of exotic plants, animals, microbes, and interacting native species. Island Press, Washington. 377 p.

Darriba, D., G.L. Taboada, R. Doallo & D. Posada. 2012. jModelTest 2: more models, new heuristics and parallel computing. Nature Methods 9:772.

Guindon, S. & O. Gascuel. 2003. A simple, fast, and accurate algorithm to estimate large phylogenies by Maximum Likelihood. Systematic Biology 52:6 96-704. DOI:10.1080/10635150390235520

Guiry, M.D. & G.M. Guiry. 2021. AlgaeBase. World-wide electronic publication. National University of Ireland, Galway, City. Available online at: https://www.algaebase.org/ (downloaded September 3, 2021).

Hendry, A.P., J.K. Wenburg, P. Bentzen, E.C. Volk & T.P. Quinn. 2000. Rapid evolution of reproductive isolation in the wild: Evidence from introduced salmon. Science 290:516-518. DOI:10.1126/science.290.5491.516

Hollenberg, G.J. 1942. Phycological notes I. Bulletin Torrey Botanical Club 69:528-538. Ilves, K.L. & E.B. Taylor. 2008. Evolutionary and biogeographical patterns within the smelt Genus Hypomesus in the North Pacific Ocean. Journal of Biogeography 35:48-64. DOI:10.1111/j.1365- 2699.2007.01782.x

INA (Index Nominum Algarum). 2020. University Herbarium, University of California, Berkeley. Compilado por P. C. Silva. Available online at: http:// ucjeps.berkeley.edu/CPD/ (downloaded September 10, 2021).

Kumar, S., G. Stecher, M. Li, C. Knyaz & K. Tamura. 2018. MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across computing platforms. Molecular Biology and Evolution 35:1547-1549.

Lee, H.W. & M.S. Kim. 2015. Species delimitation in the green algal genus Codium (Bryopsidales) from Korea using DNA barcoding. Acta Oceanologica Sinica 34:114-124.

Maddison, W.P. & D.R. Maddison. 2019. Mesquite: a modular system for evolutionary analysis. Version 3.61 http://www.mesquiteproject.org

Miller, K.A., L.E. Aguilar-Rosas & F.F. Pedroche. 2011. A review of non-native seaweeds from California, USA and Baja California, Mexico. Hidrobiológica 21:365-379.

Okolodkov, Y.B., R. Bastida-Zavala, A.L. Ibañez, J.W. Chapman, E. Suarez-Morales, F.F. Pedroche & F. Gutierrez-Mendieta. 2007. Especies acuáticas no indígenas en México. Ciencia y Mar XI:29-67.

Pedroche, F. F. 2001. Estudios filogenéticos del género Codium (Chlorophyta) en el Pacífico mexicano. Uso de ADNr mitocondrial. Anales de la Escuela Nacional de Ciencias Biológicas 47:109-123.

Pedroche, F.F., P.C. Silva & M. Chacana. 2002. El género Codium (Codiaceae, Chlorophyta) en el Pacífico de México. In: Senties, A. & K. M. Dreckmann (eds.). Monografias Ficológicas. México DF, pp.11-74.

Pedroche, F.F., P.C. Silva, L. Aguilar-Rosas, K.M. Dreckmann & R. Aguilar-Rosas. 2005. Catálogo de las algas marinas bentónicas del Pacífico de México. I. Chlorophycota. UAM, UABC, UC Berkeley, Ensenada. 136 p.

Provan, J., D. Booth, N.P. Todd, G.E. Beatty & C.A. Maggs. 2008. Tracking biological invasions in space and time: elucidating the invasive history of the green alga Codium fragile using old DNA. Diversity and Distributions 14:343-354. DOI:10.1111/j.1472-4642.2007.00420.x

Provan, J., S. Murphy & C.A. Maggs. 2005. Tracking the invasive history of the green alga Codium fragile ssp. tomentosoides. Molecular Ecology 14:189-194. DOI:10.1111/j.1365-294X.2004.02384.x

Rambaut, A. 2018. Figtree 1.4.3. http://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree.

Ree, R.H., B.R. Moore, C.O. Webb & M.J. Donoghue. 2005. A likelihood framework for inferring the evolution of geographic range on phylogenetic trees. Evolution 59:2299-2311. DOI:10.1111/j.0014-3820.2005. tb00940.x

Ronquist, F., M Teslenko, P. Van der Mark, D.L. Ayres, A. Darling, S. Höhna, B. Larget, L. Liu, M.A. Suchard & J.P. Huelsenbeck. 2012. MrBayes 3.2: Efficient bayesian phylogenetic inference and model choice across a large model space. Systematic Biology 61:539-542. DOI:10.1093/sysbio/sys029

Rueness, J. 1989. Sargassum muticum and other introduced japanese macroalgae: Biological pollution of European coast. Marine Pollution Bulletin 20: 173-176. DOI:10.1016/0025-326X(89)90488-8

Saunders, G.W. & H. Kucera. 2010. An evaluation of rbcL, tufA, UPA, LSU and ITS as DNA barcode markers for the marine green macroalgae. Cryptogamie, Algologie 31:487-528.

SEMARNAT (Secretaría de Medio Ambiente y Recursos Naturales). 2016. Acuerdo por el que se determina la Lista de las Especies Exóticas Invasoras para México. Diario Oficial de la Federación, Ciudad de México. DOF 07/12/2016.

Silva, P.C. 1951. The genus Codium in California with observations on the structure of the walls of the utricles. University of California Publications in Botany 25:79-114.

Silva, P.C. 1955. The dichotomous species of Codium in Britain. Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom 34:565- 577.

Silva, P.C. 1979. The benthic algal flora of central San Francisco Bay. In: Conomos, T.J. (ed.). San Francisco Bay: the urbanized estuary. Pacific Division, American Association for the advancement of Science, San Francisco, California, pp. 287-345.

Stecher, G., K. Tamura & S. Kumar. 2020. Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) for macOS. Molecular Biology and Evolution 37(4):1237-1239. DOI:10.1093/molbev/msz312

Swofford, D.L. 2001. PAUP*. Phylogenetic Analysis Using Parsimony (*and Other Methods). Version 4. Sinauer Associates, Sunderland, Massachusetts.

Tamura, K. & M. Nei. 1993. Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees. Molecular Biology and Evolution 10:512-526.

Thiers, B. 2021. Index Herbariorum: a global directory of public herbaria and associated staff. New York Botanical Garden’s Virtual Herbarium. Available online at: http://sweetgum.nybg.org/science/ih/ (downloaded August 28, 2021).

Trowbridge, C.D. 1996. Introduced versus native subspecies of Codium fragile: how distinctive is the invasive subspecies tomentosoides? Marine Biology 126: 193-204.

Tufiño-Velázquez, R.C. & F.F. Pedroche. 2019. Las especies del género Bryopsis (Chlorophyta) presentes en las costas del Atlántico mexicano. Revista Mexicana de Biodiversidad 90:e902679. DOI:10.22201/ ib.20078706e.2019.90.2679

Vaz-Pinto, F., I. Rodil, F. Mineur, C. Olabarria & F. Arenas. 2014. Understanding biological invasions by seaweeds. In: Pereira L. & J.M. Neto (eds.). Marine algae: biodiversity, taxonomy, environmental assessment and biotechnology. CRC Press, Boca Raton, pp. 140-177.

Verbruggen, H. & J.F. Costa. 2015. Molecular survey of Codium species diversity in southern Madagascar. Cryptogamie, Algologie 36:171-187.

Verbruggen, H., F. Leliaert, C.A. Maggs, S. Shimada, T. Schils, J. Provan, D. Booth, S. Murphy, O. De Clerck, D.S. Littler, M.M. Littler & E. Coppejans. 2007. Species boundaries and phylogenetic relationships within the green algal genus Codium (Bryopsidales) based on plastid DNA sequences. Molecular Phylogenetics and Evolution 44:240-254.

Verbruggen, H., M.J.L. Brookes J.F. & Costa. 2017. DNA barcodes and morphometric data indicate that Codium fragile (Bryopsidales, Chlorophyta) may consist of two species. Phycologia 56:54-62. DOI:10.2216/16-54.1

Wheeler, T.J. & J.D. Kececioglu. 2007. Multiple alignments by aligning alignments. Bioinformatics 23:i559-i568.

Publicado
04-02-2022
Cómo citar
F. Pedroche, F. (2022). Confirmación de la ausencia del alga marina asiática Codium fragile subsp. fragile (Codiaceae, Chlorophyta) en el Pacífico de México, mediante datos moleculares. HIDROBIOLÓGICA, 31(3). Recuperado a partir de https://hidrobiologica.izt.uam.mx/index.php/revHidro/article/view/1593
Sección
Artículos