Aislamiento y caracterización de nuevos marcadores microsatélites para la almeja generosa (Panopea generosa ) por medio de secuenciación de nueva generación
DOI:
https://doi.org/10.24275/uam/izt/dcbs/hidro/2018v28n1/RochaPalabras clave:
marcadores genéticos, microsatélites, Panopea generosa, secuenciación de siguiente generaciónResumen
Antecedentes. Panopea generosa es una almeja de gran tamaño, infáunica y longeva con un valor comercial considerable en Canadá, Estados Unidos y México, y de la que se requiere conocer su estructura genética poblacional a lo largo de su rango de distribución. Objetivos. Desarrollar nuevos marcadores microsatélites específicos para P. generosa. Métodos. En este reporte evaluamos 30 loci microsatélites generados mediante secuenciación genómica de siguiente generación (Illumina Hi-Seq 2500). Resultados. Se identificaron a ocho como marcadores genéticos polimórficos adecuados. El número de alelos por locus varió entre 5 y 22, la heterocigosidad observada entre 0.429 y 0.818 y la esperada entre 0.548 y 0.962. Tres marcadores se desviaron del equilibrio de Hardy-Weinberg, después de la corrección de DunnŠidák, como resultado de un déficit de heterocigosidad, sugiriendo la presencia de alelos nulos y se encontró desequilibrio de ligamiento entre dos microsatélites. Conclusiones. Estos marcadores son altamente informativos y útiles para estudios de genética poblacional encaminados a la implementación de medidas de administración y conservación de este valioso recurso.
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