Aislamiento y caracterización de nuevos marcadores microsatélites para la almeja generosa (Panopea generosa ) por medio de secuenciación de nueva generación

  • Celia Isabel Bisbal Pardo Molecular Ecology Laboratory, Biological Oceanography Department, CICESE, Carretera Ensenada-Tijuana 3918, Zona Playitas, Ensenada, Baja California, 22860, México
  • Miguel Angel Del Río Portilla Genetics Laboratory, Aquaculture Department, CICESE, Carretera Ensenada-Tijuana 3918, Zona Playitas, Ensenada, Baja California, 22860, México
  • Ana Yonori Castillo Paez Molecular Ecology Laboratory, Biological Oceanography Department, CICESE, Carretera Ensenada-Tijuana 3918, Zona Playitas, Ensenada, Baja California, 22860, México
  • Axayacatl Rocha Olivares Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada http://orcid.org/0000-0002-2700-9086
Palabras clave: marcadores genéticos, microsatélites, Panopea generosa, secuenciación de siguiente generación

Resumen

Antecedentes. Panopea generosa es una almeja de gran tamaño, infáunica y longeva con un valor comercial considerable en Canadá, Estados Unidos y México, y de la que se requiere conocer su estructura genética poblacional a lo largo de su rango de distribución. Objetivos. Desarrollar nuevos marcadores microsatélites específicos para P. generosa. Métodos. En este reporte evaluamos 30 loci microsatélites generados mediante secuenciación genómica de siguiente generación (Illumina Hi-Seq 2500). Resultados. Se identificaron a ocho como marcadores genéticos polimórficos adecuados. El número de alelos por locus varió entre 5 y 22, la heterocigosidad observada entre 0.429 y 0.818 y la esperada entre 0.548 y 0.962. Tres marcadores se desviaron del equilibrio de Hardy-Weinberg, después de la corrección de DunnŠidák, como resultado de un déficit de heterocigosidad, sugiriendo la presencia de alelos nulos y se encontró desequilibrio de ligamiento entre dos microsatélites. Conclusiones. Estos marcadores son altamente informativos y útiles para estudios de genética poblacional encaminados a la implementación de medidas de administración y conservación de este valioso recurso.

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Biografía del autor/a

Axayacatl Rocha Olivares, Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada
Investigador Titular D

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Publicado
30-05-2018
Cómo citar
Bisbal Pardo, C. I., Del Río Portilla, M. A., Castillo Paez, A. Y., & Rocha Olivares, A. (2018). Aislamiento y caracterización de nuevos marcadores microsatélites para la almeja generosa (Panopea generosa ) por medio de secuenciación de nueva generación. HIDROBIOLÓGICA, 28(1), 151-155. https://doi.org/10.24275/uam/izt/dcbs/hidro/2018v28n1/Rocha
Sección
Nota Científica