Structure of the mitochondrial control region and flanking tRNA genes of Mugil cephalus

Axayácatl Rocha-Olivares, Nikola M. Garber, Amber F. Garber, Kenneth C. Stuck

Resumen


We cloned and sequenced the mitochondrial (mt) control region (CR) and flanking transfer RNA genes (T, P, and F) of the striped mullet, Mugil cephalus and designed species-specific primers to amplify the entire CR in specimens from the Pacific (Hawaii), the Gulf of Mexico, and the Atlantic. We verified the absence of heteroplasmy and nuclear mtDNA duplications of this region in the organisms sampled, finding an extraordinary level of sequence divergence (mean 38-75% Tamura & Nei distance- ) between fish from both Oceans, including Japan. The CR of the mullet was variable in length (845-930 bp) and contained structural elements in common with other CRs, including a central conserved segment flanked by hypervariable regions and smaller conserved sequence blocks. Termination associated sequences, however, were not found. The CR of the striped mullet was rich in AT (~67%) and poor in GC.

Palabras clave


Mitochondrial DNA; cloning; molecular divergence; mullet; control region.

Texto completo:

PDF

Métricas de artículo

Cargando métricas ...

Metrics powered by PLOS ALM

Enlaces refback

  • No hay ningún enlace refback.


ISSN 0188-8897


 HIDROBIOLOGICA. Vol.27 Año 2017, Número 3, septiembre-diciembre de 2017, es una publicación cuatrimestral editada por la Universidad Autónoma Metropolitana, a través de la Unidad    Iztapalapa, División de Ciencias Biológicas y de la Salud, Departamento de Hidrobiología. Prolongación Canal de Miramontes 3855, colonia Ex Hacienda San Juan de Dios, delegación Tlalpan,  C.P. 14387, México, Ciudad de México y Av. San Rafael Atlixco, núm. 186, colonia Vicentina, delegación Iztapalapa, C.P. 09340, México, Ciudad de México, teléfono 5804-6475. Página  electrónica de la revista: https://hidrobiologica.izt.uam.mx y dirección electrónica: rehb@xanum.uam.mx. Editora Responsable María Esther Meave del Castillo. Certificado de Reserva de  Derechos al Uso Exclusivo de Título No. 04-2010-072711181500-203, ISSN para versión impresa e ISSN para revista electrónica son otorgados por el Instituto Nacional del Derecho de Autor. Responsable de la última actualización  de este número María Esther Meave del Castillo, Universidad Autónoma Metropolitana Unidad Iztapalapa, Av. San Rafael Atlixco, núm. 186, colonia Vicentina, delegación Iztapalapa, C.P.  09340, México, Ciudad de México. Fecha de última modificación: 28 de diciembre de 2017. Tamaño de archivo: 30 MB.Las opiniones expresadas por los autores no necesariamente reflejan la  postura del editor de la publicación.Queda estrictamente prohibida la reproducción total o parcial de los contenidos e imágenes de la publicación sin previa autorización de la Universidad  Autónoma Metropolitana. 

ISSN para versión impresa 0188-8897 

ISSN para version electronica 2448-7333