Structure of the mitochondrial control region and flanking tRNA genes of Mugil cephalus

Authors

  • Axayácatl Rocha-Olivares Department of Biological Oceanography, CICESE, km 107 Carretera Tijuana-Ensenada, Ensenada B. C. 22860
  • Nikola M. Garber NOAA Sea Grant, 1315 East West Highway, R/SG, Rm 11718, Silver Spring, Maryland 20910
  • Amber F. Garber North Carolina State University, Department of Zoology, Campus Box 7617, Raleigh, North Carolina 27695-7617
  • Kenneth C. Stuck Gulf Coast Research Laboratory, University of Southern Mississippi, PO Box 7000, Ocean Springs, Mississippi 39566-7000 Dr. Axayácatl Rocha-Olivares CICESE-Department of Biological Oceanography Tel: (646) 175-0500 x 24240 Fax: (646) 175-0545

Keywords:

Mitochondrial DNA, cloning, molecular divergence, mullet, control region.

Abstract

We cloned and sequenced the mitochondrial (mt) control region (CR) and flanking transfer RNA genes (T, P, and F) of the striped mullet, Mugil cephalus and designed species-specific primers to amplify the entire CR in specimens from the Pacific (Hawaii), the Gulf of Mexico, and the Atlantic. We verified the absence of heteroplasmy and nuclear mtDNA duplications of this region in the organisms sampled, finding an extraordinary level of sequence divergence (mean 38-75% Tamura & Nei distance- ) between fish from both Oceans, including Japan. The CR of the mullet was variable in length (845-930 bp) and contained structural elements in common with other CRs, including a central conserved segment flanked by hypervariable regions and smaller conserved sequence blocks. Termination associated sequences, however, were not found. The CR of the striped mullet was rich in AT (~67%) and poor in GC.

Downloads

Download data is not yet available.

Downloads

Published

2017-01-17

How to Cite

Rocha-Olivares, A., Garber, N. M., Garber, A. F., & Stuck, K. C. (2017). Structure of the mitochondrial control region and flanking tRNA genes of Mugil cephalus. HIDROBIOLÓGICA, 15(2), 139–149. Retrieved from https://hidrobiologica.izt.uam.mx/hidrobiologica/index.php/revHidro/article/view/1059

Issue

Vol. 15 No. 2 (2005): Número especial: Ictiología

Section

Artículos

License

Los autores/as que publiquen en esta revista aceptan las siguientes condiciones:

De acuerdo con la legislación de derechos de autor, HIDROBIOLÓGICA reconoce y respeta el derecho moral de los autores, así como la titularidad del derecho patrimonial, el cual será cedido a la revista para su difusión en acceso abierto.

Publicar en la revista HIDROBIOLÓGICA tiene un costo de recuperación de $500 pesos mexicanos por página en blanco y negro (aproximadamente 29 dólares americanos) y $1000 pesos por página a color (aproximadamente 58 dólares americanos).

Todos los textos publicados por HIDROBIOLÓGICA sin excepción se distribuyen amparados bajo la licencia Creative Commons 4.0Atribución-No Comercial (CC BY-NC 4.0 Internacional), que permite a terceros utilizar lo publicado siempre que mencionen la autoría del trabajo y a la primera publicación en esta revista.

Los autores/as pueden realizar otros acuerdos contractuales independientes y adicionales para la distribución no exclusiva de la versión del artículo publicado en HIDROBIOLÓGICA (por ejemplo incluirlo en un repositorio institucional o publicarlo en un libro) siempre que indiquen claramente que el trabajo se publicó por primera vez en HIDROBIOLÓGICA.

Para todo lo anterior, el o los autor(es) deben remitir el formato de Carta-Cesión de la Propiedad de los Derechos de la primera publicación debidamente requisitado y firmado por el autor(es). Este formato se puede enviar por correo electrónico en archivo pdf al correo: enlacerebvistahidrobiológica@gmail.com; rehb@xanum.uam.mx (Carta-Cesión de Propiedad de Derechos de Autor).

Esta obra está bajo una licencia de Creative Commons Reconocimiento-No Comercial 4.0 Internacional.