A multidisciplinary approach to identify pelagic shark fins by molecular, morphometric and digital correlation data

Sebastián Hernández, Cristian Gallardo-Escárate, Josué Álvarez-Borrego, María Teresa González, Pilar A. Haye

Resumen


Accurate species identification is one of the most important issues to conserve and manage shark fisheries. A multidisciplinary approach involving molecular (using variation at ITS2 sequences), morphometrical and image processing species identification was performed to evaluate their discriminating power with three pelagic shark species common to the coasts of Chile (Prionace glauca Linnaeus 1785, Isurus oxyrinchus Rafinesque 1810, and Lamna nasus (Bonnaterre, 1788). Species-specific DNA markers and multivariate analyses based on twenty morphometrical measurements were used to identify fresh and dry fin sets for each shark species. Additionally, coloring patterns and fin shape were jointly used to distinguish dry fin sets of shark species by using digital invariant correlation (relation target and problem image independent of their changes in position, scale and rotation). Our results showed that morphometrical analysis was the least accurate approach, whereas DNA-based identification and image processing approaches were 100% successful on the identification of shark species. Thus ITS2 sequences and morphological diagnostic characteristics such as the ones related to color patterns, allow the correct identification of shark species. Therefore, the implementation of molecular and/or image tools can be applied to confidently identify the main pelagic shark species involved in Chilean landing and fin trade.

Palabras clave


Invariant digital correlation; molecular markers; multivariate analysis; pelagic sharks.

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ISSN 0188-8897

 HIDROBIOLOGICA. Vol.26 Año 2016, Número 3, septiembre-diciembre de 2016, es una publicación cuatrimestral editada por la Universidad Autónoma Metropolitana, a través de la Unidad    Iztapalapa, División de Ciencias Biológicas y de la Salud, Departamento de Hidrobiología. Prolongación Canal de Miramontes 3855, colonia Ex Hacienda San Juan de Dios, delegación Tlalpan,  C.P. 14387, México, Ciudad de México y Av. San Rafael Atlixco, núm. 186, colonia Vicentina, delegación Iztapalapa, C.P. 09340, México, Ciudad de México, teléfono 5804-6475. Página  electrónica de la revista: http://hidrobiologica.izt.uam.mx y dirección electrónica: rehb@xanum.uam.mx. Editora Responsable María Esther Meave del Castillo. Certificado de Reserva de  Derechos al Uso Exclusivo de Título No. 04-2010-072711181500-203, ISSN para version impresa e ISSN para revista electronica son otorgados por el Instituto Nacional del Derecho de Autor. Responsable de la última actualización  de este número María Esther Meave del Castillo, Universidad Autónoma Metropolitana Unidad Iztapalapa, Av. San Rafael Atlixco, núm. 186, colonia Vicentina, delegación Iztapalapa, C.P.  09340, México, Ciudad de México. Fecha de última modificación: 2 de marzo de 2017. Tamaño de archivo: 30 MB.Las opiniones expresadas por los autores no necesariamente reflejan la  postura del editor de la publicación.Queda estrictamente prohibida la reproducción total o parcial de los contenidos e imágenes de la publicación sin previa autorización de la Universidad  Autónoma Metropolitana. 

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